27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0380 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0380  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  517  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.491044  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  27.95 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  30.05 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  32.34 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  33.75 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  31.76 
 
 		 328 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  27.46 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  24.91 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  24.37 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  26.75 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  26.75 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  25.58 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  25.88 
 
 		 319 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  23.84 
 
 		 319 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  23.34 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0474  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.37 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  23.34 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  22.94 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  22.73 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  25.45 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  28.22 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  22.9 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  23.34 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  24.04 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  24.44 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  23 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>