83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2654 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  100 
 
 		 279 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  53.5 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0380  hypothetical protein  33.66 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.491044  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  29.54 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  30.15 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  32.02 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  24.18 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  27.04 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  22.3 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.88 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  21.38 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  21.45 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  21.03 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  21.03 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  21.03 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  21.45 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  21.45 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  21.45 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  21.11 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  22.22 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  26.11 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  24.65 
 
 		 323 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  28.35 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  22.46 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.59 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  21.11 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  23.18 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  20.92 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.21 
 
 		 384 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.74 
 
 		 502 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.74 
 
 		 502 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.74 
 
 		 502 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.74 
 
 		 502 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.74 
 
 		 502 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  26.32 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  40.74 
 
 		 485 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  40.74 
 
 		 461 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  38.27 
 
 		 498 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  38.27 
 
 		 498 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  38.27 
 
 		 499 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  38.27 
 
 		 498 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 		 435 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  23.76 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  38.27 
 
 		 499 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  40.58 
 
 		 575 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 		 423 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.18 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  38.27 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  30.08 
 
 		 491 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.27 
 
 		 485 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  39.62 
 
 		 496 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.27 
 
 		 490 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  35.71 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03095  serine endoprotease, periplasmic  41.51 
 
 		 355 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03046  hypothetical protein  41.51 
 
 		 355 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  32.1 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  21.79 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3541  serine endoprotease  41.51 
 
 		 355 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.360038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2926  hypothetical protein  46.15 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.657336  normal  0.332797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3718  serine endoprotease  41.51 
 
 		 355 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  34.85 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  42.59 
 
 		 511 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  42.31 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  40.35 
 
 		 525 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4552  serine endoprotease  41.51 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0248117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3531  serine endoprotease  41.51 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00943485  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0471  periplasmic serine protease DegS  41.51 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.183239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3424  serine endoprotease  41.51 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109706  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0471  serine endoprotease  41.51 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.12 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  38.46 
 
 		 383 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  22.1 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 482 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.51 
 
 		 436 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  35.71 
 
 		 482 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.98 
 
 		 552 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  26.98 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  26.98 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  26.91 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  26.55 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  20.8 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  40 
 
 		 528 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.19 
 
 		 388 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>