48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2028 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 282 aa  557  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  27.03 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  29.38 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  26.87 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  27.08 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  28.09 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  29.17 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  26.26 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  26.62 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  25.9 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  25.08 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  25.63 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  25.08 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  25.09 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  25.09 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  25.09 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  25.09 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1348  hypothetical protein  34.75 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.671423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  26.47 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  25.61 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  27.1 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  27.11 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  27.08 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  25.8 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  23.13 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  28.34 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2590  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.69 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  25.26 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  26.34 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  33.12 
 
 		 359 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0380  hypothetical protein  27.65 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.491044  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  23.88 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  25.49 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  22.64 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  23.19 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  24.91 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2926  hypothetical protein  32.97 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.657336  normal  0.332797 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0926  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  41.79 
 
 		 489 aa  49.3  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2029  secretion protein XcpP  34.09 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  29.26 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  33.71 
 
 		 476 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23980  secretion protein XcpP  36.71 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  24.1 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  22.03 
 
 		 319 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  25.58 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.84 
 
 		 388 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>