19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2926 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2926  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.657336  normal  0.332797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2029  secretion protein XcpP  47.06 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23980  secretion protein XcpP  47.87 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4163  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.962185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1348  hypothetical protein  28.21 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.671423  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  32.77 
 
 		 302 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  34.06 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  32.52 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40330  hypothetical protein  37.37 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3421  hypothetical protein  43.28 
 
 		 163 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  28.67 
 
 		 285 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1417  outer membrane secretion protein P  34.44 
 
 		 170 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2590  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.21 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  25.48 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  44.12 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  26.42 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  44.12 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0956  hypothetical protein  24.46 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  26.27 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>