48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0314 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  100 
 
 		 288 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  47.67 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  33.15 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  26.25 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  24.49 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  24.92 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  28.34 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  25.8 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  25.25 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  28.12 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  26.21 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  26.7 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  25 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  24.82 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  27.87 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  27.18 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  24.36 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  24.36 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  24.36 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  24.45 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  29.33 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  21.43 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  26.48 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  23.49 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0380  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.491044  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  23.1 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  24.15 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  23.84 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  24.3 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4163  hypothetical protein  36.15 
 
 		 177 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.962185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  25.67 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  26.83 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2926  hypothetical protein  31.65 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.657336  normal  0.332797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1901  putative general secretion pathway related transmembrane protein  37.89 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  36.05 
 
 		 491 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3571  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.7 
 
 		 701 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.226926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23980  secretion protein XcpP  35.92 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2029  secretion protein XcpP  34.69 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  35.21 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  34.69 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  30.93 
 
 		 520 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.21 
 
 		 614 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  32.93 
 
 		 374 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  38.37 
 
 		 404 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  33.33 
 
 		 452 aa  42.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.71 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  31.96 
 
 		 504 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  39.29 
 
 		 383 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>