18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1901 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1901  putative general secretion pathway related transmembrane protein  100 
 
 		 176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3218  hypothetical protein  33.95 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3043  putative general secretion pathway related transmembrane protein  33.57 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3381  hypothetical protein  34.31 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3105  putative general secretion pathway related transmembrane protein  39.68 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79717  normal  0.98729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3390  putative general secretion pathway related transmembrane protein  32.86 
 
 		 227 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  38.67 
 
 		 288 aa  47.8  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0010  GspC  31.39 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2783  general secretion pathway protein C  30.66 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2665  general secretion pathway protein C  30.66 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0010  general secretion pathway protein C  30.66 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0010  general secretion pathway protein C  30.66 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1887  general secretion pathway protein C  30.66 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.730387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3515  general secretion pathway protein C  30.66 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0223  GspC  30.66 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  38.04 
 
 		 302 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0059  hypothetical protein  36.76 
 
 		 136 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0011  hypothetical protein  36.76 
 
 		 136 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>