56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0140 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 285 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  27.5 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  28.12 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  26.8 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  30.63 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  26.95 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  25.52 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  26.78 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  24.25 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  25.83 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  25 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  25.25 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  24.78 
 
 		 359 aa  72  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  25.25 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  25.25 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  24.92 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  24.41 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  24.25 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  25.08 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  25.86 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  26.16 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  25.94 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  29.94 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  24.39 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  23.59 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  23.59 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  23.49 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  23.94 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  23.94 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  23.94 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  23.05 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  23.48 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  23.18 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  24.47 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  26.92 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  21.58 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  23.6 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  24.06 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  25.95 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  23.13 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  30.06 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  22.42 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  30.39 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.6 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.87 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2926  hypothetical protein  28.67 
 
 		 213 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.657336  normal  0.332797 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0002  general secretion pathway protein C  24.3 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.856958  normal  0.237385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  25.26 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  36.36 
 
 		 496 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.25 
 
 		 426 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03175  general secretory pathway component, cryptic  20.98 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0389  general secretion pathway protein C  20.98 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000776949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03126  hypothetical protein  20.98 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.013931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0389  general secretion pathway protein C  20.98 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125631  normal  0.017456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3518  general secretion pathway protein C  20.98 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000156607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  38.46 
 
 		 504 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>