40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0389 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03175  general secretory pathway component, cryptic  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0389  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000776949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03126  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.013931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0389  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125631  normal  0.017456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3518  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000156607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  25.71 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  23.72 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  22.62 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  24.54 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  26.6 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  26.6 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  27.13 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  26.6 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  22.84 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  24.63 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  25.4 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  25.4 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  25.4 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  25.4 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  25.51 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  25.95 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  22.5 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  24.46 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  22.93 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  24.27 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  23.16 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  24.3 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  24.54 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  24.54 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  24.54 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  24.3 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  21.93 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  23.83 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  21 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  28.37 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  23.91 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  27.33 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  21 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  24.19 
 
 		 305 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  23.5 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>