48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1298 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 272 aa  560  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  71.17 
 
 		 274 aa  394  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  50.55 
 
 		 290 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  52.99 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  30.23 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0002  general secretion pathway protein C  34.17 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.856958  normal  0.237385 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  28.86 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  27.87 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  30.11 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  27.3 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  27.3 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  29.03 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  26.78 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  25.17 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  25.17 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  26.55 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  25.17 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  25.71 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  25.17 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  26.32 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  25.96 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  25.96 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  25.35 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  26.28 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  27.4 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  25.85 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  30.56 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  24.83 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  24.09 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  26.72 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  30.33 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  27.36 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  24.73 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  24.73 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  25.44 
 
 		 319 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  24.73 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  25.52 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  26.02 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03175  general secretory pathway component, cryptic  24.29 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0389  general secretion pathway protein C  24.29 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000776949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03126  hypothetical protein  24.29 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.013931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3518  general secretion pathway protein C  24.29 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000156607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0389  general secretion pathway protein C  24.29 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125631  normal  0.017456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  24.34 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  26.4 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  22.94 
 
 		 428 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1348  hypothetical protein  32.8 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.671423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  22.51 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>