34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1348 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1348  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.671423  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  35 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  34.75 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  37.86 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  31.28 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  31.28 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  31.28 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23980  secretion protein XcpP  27.57 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  30.73 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2029  secretion protein XcpP  26.64 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  31.07 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  31.07 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  31.64 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2926  hypothetical protein  28.85 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.657336  normal  0.332797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  31.18 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  31.65 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  30 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  27.1 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  33.33 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  29.29 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  29.56 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  31.36 
 
 		 303 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  32.24 
 
 		 359 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  40.58 
 
 		 304 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0926  hypothetical protein  31.65 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0956  hypothetical protein  23.65 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  24.76 
 
 		 307 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  28.93 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  28.77 
 
 		 303 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  32.8 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  27.88 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  28 
 
 		 272 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  27.16 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2590  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.31 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>