47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2376 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 359 aa  698    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  31.74 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  32.27 
 
 		 302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  24.11 
 
 		 303 aa  93.2  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  25.07 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  23.88 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  26.95 
 
 		 284 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  25.72 
 
 		 307 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  25.07 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  26.33 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  24.79 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  24.79 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  23.93 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  23.81 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  23.51 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  26.07 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  25.69 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  25.69 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  25.83 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  25.69 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  23.51 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  25.07 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  25.31 
 
 		 284 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  24.32 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  23.88 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  26.38 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  23.56 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  23.42 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  24.24 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  24.25 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  23.42 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  23.72 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  22.32 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  29.11 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  20.94 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  26.13 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1348  hypothetical protein  35.79 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.671423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  28.75 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  27.03 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2029  secretion protein XcpP  30.77 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23980  secretion protein XcpP  30.13 
 
 		 235 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  43.08 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  26.37 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0731  hypothetical protein  30.77 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0148909  normal  0.986214 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  18.75 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  38.89 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  25.31 
 
 		 272 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>