74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0224 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 302 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  42.86 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  31.27 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  31.27 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  31.27 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  31.27 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  29.58 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  31.23 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  30.45 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  29.76 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  30.34 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  30.69 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  31.79 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  30.72 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  30.6 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  30.36 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  30.34 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  30.14 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  29.53 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  30.25 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  28.67 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  26.33 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  32.62 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  29.08 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  28.24 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  30.59 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  29.52 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  29.33 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  30.04 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  31.4 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  25.54 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  38.41 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  30.62 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  30.62 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  30.28 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  27.65 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  26.51 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  31.28 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  25.87 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2590  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.09 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  31.2 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  25.64 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1348  hypothetical protein  35 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.671423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  26.07 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0389  general secretion pathway protein C  24.54 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125631  normal  0.017456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03175  general secretory pathway component, cryptic  24.54 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03126  hypothetical protein  24.54 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.013931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0389  general secretion pathway protein C  24.54 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000776949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3518  general secretion pathway protein C  24.54 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000156607  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0956  hypothetical protein  28.09 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0926  hypothetical protein  28.09 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0002  general secretion pathway protein C  22.73 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.856958  normal  0.237385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0380  hypothetical protein  28.46 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.491044  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2926  hypothetical protein  32.77 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.657336  normal  0.332797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  29.03 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2029  secretion protein XcpP  34.78 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  23.79 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  20.09 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23980  secretion protein XcpP  34.78 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  25.2 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  30.34 
 
 		 496 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  22.79 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.58 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1417  outer membrane secretion protein P  42.42 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  29.79 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.23 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  25.77 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  38.18 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.95 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  29.35 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  27.84 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  29.21 
 
 		 496 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  29.21 
 
 		 496 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.57 
 
 		 614 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>