40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0002 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0002  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.856958  normal  0.237385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  38.1 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  34.17 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  34.14 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  39.91 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  28.2 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  27.56 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  29.2 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  29.26 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  30.47 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  27.5 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  28.51 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  28.95 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  29.52 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  29.63 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  29.52 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  29.52 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  29.52 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  28.07 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  28.07 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  27.82 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  28.95 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  29.35 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  29.07 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  28.93 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  26.7 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  23.69 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  25.78 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  23.55 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  27.71 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  25.33 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  25.33 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  25.33 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  25.33 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  26.4 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  26.58 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  22.73 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  25 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  22.67 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  25.68 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>