26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4252 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4252  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  360  8e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  40.85 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  40.85 
 
 		 308 aa  57.8  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  40 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  40 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  38.57 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  34.94 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  40 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  40 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  40 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  40 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  41.43 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  31.68 
 
 		 307 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  35.14 
 
 		 305 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  37.14 
 
 		 303 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  37.14 
 
 		 301 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3316  hypothetical protein  31.11 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  35.71 
 
 		 303 aa  48.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  24.58 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3270  general secretion pathway protein C  33.33 
 
 		 91 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341885  hitchhiker  0.000000000000343559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  36 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1003  general secretion pathway protein C  33.33 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0952  general secretion pathway protein C-like protein  33.33 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  36.76 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  34.29 
 
 		 303 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  32.86 
 
 		 307 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>