More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5255 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5255  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443087  normal  0.0197845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.7 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2089  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 307 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0769  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4464  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0700  putative transcriptional regulator  43.49 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3745  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1757  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1136  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2088  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2315  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.958011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2431  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2030  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  31.51 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7777  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1889  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.457269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1944  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2438  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2021  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2089  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2032  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10229  hitchhiker  0.000329187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1930  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2193  transcriptional regulator, LysR family protein  29.69 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000418662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1875  regulatory protein, LysR  30.3 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2584  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1852  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1789  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  32.53 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  33.91 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  32.18 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2592  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6436  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.68 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4929  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4801  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0716178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1570  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0308383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  25.94 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5569  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5934  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0537  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.0745135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0757  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65970  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4978  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  28.04 
 
 		 322 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1027  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.361847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  25.66 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2269  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5724  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2465  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1175  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0612  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1683  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2375  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>