208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  100 
 
 		 1062 aa  2172    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  34.33 
 
 		 914 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  36.83 
 
 		 1171 aa  209  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  34.8 
 
 		 1176 aa  208  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  36.34 
 
 		 1178 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  35.34 
 
 		 975 aa  204  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  36.06 
 
 		 1178 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  36.05 
 
 		 1190 aa  202  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  33.49 
 
 		 1185 aa  173  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  29.55 
 
 		 1335 aa  155  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  30.57 
 
 		 1132 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  30.51 
 
 		 925 aa  96.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.55 
 
 		 946 aa  95.9  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  25.92 
 
 		 958 aa  91.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.48 
 
 		 1203 aa  88.6  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  29.79 
 
 		 932 aa  88.6  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  23.39 
 
 		 1002 aa  88.6  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  29.55 
 
 		 916 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  29.69 
 
 		 922 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  27.25 
 
 		 914 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1474 aa  80.1  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.57 
 
 		 1196 aa  78.2  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  27.59 
 
 		 1790 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.01 
 
 		 629 aa  77.4  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  29.06 
 
 		 1523 aa  76.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  26.96 
 
 		 1490 aa  75.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1100 aa  74.7  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  23.8 
 
 		 1973 aa  74.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  28.24 
 
 		 1489 aa  74.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  24.84 
 
 		 905 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  24.84 
 
 		 905 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  26.9 
 
 		 1094 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  27.07 
 
 		 1061 aa  72.8  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  25.81 
 
 		 2013 aa  72  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.16 
 
 		 905 aa  71.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  26.74 
 
 		 928 aa  71.6  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  25.32 
 
 		 907 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.34 
 
 		 1363 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.42 
 
 		 752 aa  70.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  24.83 
 
 		 1121 aa  70.1  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  28.44 
 
 		 1557 aa  69.7  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  26.11 
 
 		 2204 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  25.36 
 
 		 1296 aa  68.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  26.02 
 
 		 2016 aa  69.3  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  24.26 
 
 		 903 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  27.43 
 
 		 1196 aa  68.9  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  24.05 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1823 aa  68.6  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  25 
 
 		 758 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  26.12 
 
 		 1630 aa  68.6  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  24.1 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  24.2 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  28.13 
 
 		 1622 aa  67.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1220 aa  67.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1652 aa  67.4  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1092 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  26.42 
 
 		 1087 aa  67  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1888 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  25.71 
 
 		 1697 aa  66.6  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  25.14 
 
 		 1056 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  24.84 
 
 		 905 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  26.69 
 
 		 1980 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.46 
 
 		 1477 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  24.33 
 
 		 2096 aa  66.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  26.38 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  24.2 
 
 		 905 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  25.6 
 
 		 1622 aa  66.6  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1328 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  24.42 
 
 		 906 aa  65.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  24.85 
 
 		 2207 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  25.36 
 
 		 2197 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  25.37 
 
 		 1651 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  26.5 
 
 		 1163 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  24.91 
 
 		 609 aa  64.3  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  25.37 
 
 		 1958 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  28.52 
 
 		 1991 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1572 aa  63.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1724 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  24.4 
 
 		 904 aa  63.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  24.37 
 
 		 1653 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1049 aa  63.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  25 
 
 		 1861 aa  63.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  23.05 
 
 		 636 aa  63.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  26.9 
 
 		 651 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  40.59 
 
 		 606 aa  62  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  25.29 
 
 		 1803 aa  62  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  24.13 
 
 		 1038 aa  61.6  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  25.44 
 
 		 1559 aa  61.6  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.43 
 
 		 902 aa  61.6  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  24.34 
 
 		 1189 aa  61.6  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1126 aa  61.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.37 
 
 		 632 aa  61.6  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  30.7 
 
 		 1387 aa  60.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  26.82 
 
 		 2002 aa  60.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  24.48 
 
 		 1754 aa  61.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  24.7 
 
 		 619 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  25.56 
 
 		 2005 aa  60.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  22.28 
 
 		 716 aa  61.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.71 
 
 		 1959 aa  60.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  24.75 
 
 		 1153 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>