61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3422 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 343 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  50.89 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  53.72 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  47.44 
 
 		 317 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  46.79 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  50.58 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  54.87 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  44.41 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  43.93 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  45.35 
 
 		 339 aa  222  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  44.9 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  46.06 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  44.98 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  44.79 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  41.77 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  42.95 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  42.95 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  42.46 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  42.04 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  41.04 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  42.26 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  39.68 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  41.4 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  37.54 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  39.63 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  38.44 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  39.48 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  36.33 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  36.1 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  36.1 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  36.1 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  30.7 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  40.07 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  35.96 
 
 		 316 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  36.66 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  32.37 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  27.84 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  33.86 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.88 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.4 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.81 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  28.17 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.61 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  28.24 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.4 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  27.17 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  21.73 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  21.43 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.55 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.08 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.39 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.77 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  28.81 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  23.25 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  29.48 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.73 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.57 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.69 
 
 		 344 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>