146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2790 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  62.67 
 
 		 221 aa  255  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  56.77 
 
 		 227 aa  235  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 227 aa  208  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  51.13 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  36.11 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  25.93 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  34.38 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  33.8 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  31.65 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  32.79 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  31.75 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  31.75 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  31.75 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  31.75 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  31.75 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  45.1  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28950  Transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  31.58 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0558  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  30.16 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.16 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  30.16 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2860  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.253372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  30.16 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  30.16 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>