More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2350 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2350  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4665  pentapeptide repeat protein  53.85 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  44.68 
 
 		 745 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 		 438 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  31.74 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  35 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  39.36 
 
 		 266 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  29.46 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  44.87 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 		 567 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  42.39 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  47.42 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  35.04 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 		 408 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 446 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  34.06 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  41.94 
 
 		 292 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  40.59 
 
 		 521 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  40.7 
 
 		 824 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  37.04 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  30.84 
 
 		 216 aa  53.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 300 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  37.37 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  33.61 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1033 aa  52.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  37.82 
 
 		 442 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  37.62 
 
 		 386 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  34.92 
 
 		 885 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  39.53 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  35.85 
 
 		 973 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  36.52 
 
 		 600 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  48.33 
 
 		 903 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  43.21 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.09 
 
 		 340 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  48.39 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.44 
 
 		 234 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.22 
 
 		 447 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  30.77 
 
 		 366 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.11 
 
 		 222 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 216 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  45.65 
 
 		 345 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  55.17 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  55.17 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  40.45 
 
 		 222 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  29.2 
 
 		 227 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  32.53 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  30.13 
 
 		 366 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  37.63 
 
 		 325 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  34.92 
 
 		 204 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  30.88 
 
 		 319 aa  50.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  41.57 
 
 		 278 aa  50.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  34.75 
 
 		 239 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  32.88 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  38.54 
 
 		 389 aa  50.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  36.17 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  34.96 
 
 		 389 aa  50.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  34.15 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 900 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  44.16 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  27.61 
 
 		 401 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 489 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  31.31 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  27.61 
 
 		 401 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  37.07 
 
 		 293 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  37.07 
 
 		 311 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 		 1191 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  42.27 
 
 		 290 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  38.68 
 
 		 971 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.75 
 
 		 862 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03095  hypothetical protein  43.1 
 
 		 379 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 872 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.81 
 
 		 201 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  43.42 
 
 		 233 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  27.91 
 
 		 362 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 391 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  29.49 
 
 		 366 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  48.33 
 
 		 277 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  46.88 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 		 776 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  37.63 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.6 
 
 		 14916 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.61 
 
 		 449 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  37.63 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 		 332 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>