More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0408 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  54.31 
 
 		 952 aa  681    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  51.23 
 
 		 874 aa  671    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  48.88 
 
 		 974 aa  694    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  47.16 
 
 		 949 aa  648    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 972 aa  1858    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  49.18 
 
 		 875 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  45 
 
 		 934 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  46.81 
 
 		 923 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  43.09 
 
 		 928 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  39.79 
 
 		 988 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  45.19 
 
 		 999 aa  568  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.39 
 
 		 824 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  44.77 
 
 		 811 aa  545  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  44.97 
 
 		 851 aa  544  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.45 
 
 		 927 aa  474  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  30.17 
 
 		 972 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  29.14 
 
 		 893 aa  288  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  28.87 
 
 		 881 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  25.51 
 
 		 875 aa  264  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  29.94 
 
 		 904 aa  252  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  38.05 
 
 		 747 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.39 
 
 		 889 aa  202  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  34.5 
 
 		 902 aa  197  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  34.95 
 
 		 905 aa  197  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  37.38 
 
 		 882 aa  193  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  37.26 
 
 		 882 aa  184  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 831 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  29.8 
 
 		 864 aa  181  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.22 
 
 		 712 aa  179  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  30.25 
 
 		 733 aa  177  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.39 
 
 		 1212 aa  177  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  35.65 
 
 		 898 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  26.09 
 
 		 839 aa  174  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.04 
 
 		 813 aa  174  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.26 
 
 		 1343 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  25.98 
 
 		 866 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  40 
 
 		 849 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  31.54 
 
 		 832 aa  163  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.24 
 
 		 966 aa  161  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.24 
 
 		 839 aa  160  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  32.35 
 
 		 763 aa  160  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.85 
 
 		 1357 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  24.77 
 
 		 857 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  30 
 
 		 717 aa  158  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.56 
 
 		 766 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.11 
 
 		 762 aa  151  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  34.56 
 
 		 777 aa  150  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  29.07 
 
 		 803 aa  149  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.95 
 
 		 782 aa  146  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  26.4 
 
 		 1548 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 763 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  33.6 
 
 		 763 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 805 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  33.7 
 
 		 808 aa  140  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  33.1 
 
 		 737 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.22 
 
 		 755 aa  138  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  32.79 
 
 		 763 aa  138  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  30.96 
 
 		 787 aa  138  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.22 
 
 		 755 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.22 
 
 		 765 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.22 
 
 		 755 aa  138  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.22 
 
 		 755 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.79 
 
 		 763 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  32.64 
 
 		 915 aa  137  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.26 
 
 		 772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  32.52 
 
 		 763 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  31.73 
 
 		 743 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.44 
 
 		 750 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.88 
 
 		 756 aa  135  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  35.37 
 
 		 693 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.52 
 
 		 760 aa  134  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 		 760 aa  134  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.33 
 
 		 774 aa  134  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.79 
 
 		 749 aa  134  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.5 
 
 		 792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  28.54 
 
 		 727 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  28.54 
 
 		 727 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.86 
 
 		 734 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.93 
 
 		 765 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  30.93 
 
 		 765 aa  132  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  30.93 
 
 		 765 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.35 
 
 		 784 aa  131  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  30.93 
 
 		 765 aa  131  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.98 
 
 		 769 aa  131  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  33.71 
 
 		 790 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.77 
 
 		 757 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.25 
 
 		 902 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  32.58 
 
 		 850 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  30.67 
 
 		 765 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  30.67 
 
 		 765 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  31.43 
 
 		 914 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35668  beta-xylosidase  28.93 
 
 		 682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.68 
 
 		 751 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.23 
 
 		 933 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  30.67 
 
 		 765 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  30.67 
 
 		 765 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.44 
 
 		 804 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  30.4 
 
 		 765 aa  129  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.98 
 
 		 760 aa  129  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  31.14 
 
 		 739 aa  128  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>