136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2529 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
428 aa  826    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  47.33 
 
 
432 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 
435 aa  275  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
491 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 
453 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
434 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  37.78 
 
 
433 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  39.31 
 
 
441 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  37.14 
 
 
432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  34.38 
 
 
436 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
427 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
442 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  35.31 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 
431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
441 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
434 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  35.38 
 
 
476 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  34.47 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  30.81 
 
 
441 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  30.31 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
416 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  28.29 
 
 
454 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  29.81 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  29.81 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  29.81 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  25.96 
 
 
707 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  26.88 
 
 
533 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  27.39 
 
 
481 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  24.56 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  24.57 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  24.1 
 
 
460 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  24.44 
 
 
471 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  28.35 
 
 
543 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  25.12 
 
 
547 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  26.53 
 
 
598 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  27.27 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  26.67 
 
 
709 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
482 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  26.94 
 
 
705 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.3 
 
 
730 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  28.37 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  27.95 
 
 
529 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  26.96 
 
 
686 aa  56.6  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  23.93 
 
 
460 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  26.9 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.95 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  24.11 
 
 
462 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  26.61 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  27.3 
 
 
512 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  26.04 
 
 
703 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
448 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.64 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.64 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  26.47 
 
 
543 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  23.28 
 
 
429 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
560 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
450 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  23.64 
 
 
424 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  25.16 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  26.32 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.51 
 
 
1833 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.49 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  25.65 
 
 
415 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  29.24 
 
 
424 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.23 
 
 
445 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.84 
 
 
415 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  25.48 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  25.48 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  25.48 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  25.48 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  25.48 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 
515 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  26.58 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  27.48 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.37 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  29.89 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  22.75 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  22.53 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  25.16 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  30.66 
 
 
688 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  24.61 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  24.87 
 
 
449 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  22.67 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.66 
 
 
404 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
423 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  23.42 
 
 
578 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  25.06 
 
 
420 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5239  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 
459 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
439 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  24.86 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  28.22 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>