More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2196 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  64.78 
 
 		 1189 aa  1159    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1335 aa  2652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  60.03 
 
 		 1267 aa  1484    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  39.58 
 
 		 1068 aa  602  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  35.41 
 
 		 1042 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  34.52 
 
 		 1045 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  36.15 
 
 		 1039 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  34.42 
 
 		 1038 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  44.74 
 
 		 1067 aa  439  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  43.37 
 
 		 1069 aa  429  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.72 
 
 		 1052 aa  423  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  46.48 
 
 		 1041 aa  419  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  29.28 
 
 		 1024 aa  414  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1038 aa  411  1e-113  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  43.37 
 
 		 1048 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 1034 aa  406  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  45.25 
 
 		 1044 aa  406  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  40.74 
 
 		 1057 aa  402  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.09 
 
 		 1032 aa  387  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  42.69 
 
 		 1033 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  25.39 
 
 		 1025 aa  337  7e-91  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1191 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  36.16 
 
 		 1092 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  25.52 
 
 		 1134 aa  296  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  27.42 
 
 		 1165 aa  293  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1146 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  35.03 
 
 		 1043 aa  290  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1143 aa  286  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1290 aa  280  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1124 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1164  acriflavin resistance protein  24.05 
 
 		 1110 aa  218  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1029 aa  218  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  22.72 
 
 		 1020 aa  210  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  28.55 
 
 		 1020 aa  209  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1029 aa  208  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1040 aa  204  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1028 aa  197  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1044 aa  194  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 		 1050 aa  194  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1034 aa  193  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  28.87 
 
 		 1035 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1031 aa  191  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1026 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1051 aa  188  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  23.2 
 
 		 1034 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1048 aa  186  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4181  acriflavin resistance protein  23.4 
 
 		 1093 aa  186  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.644693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1028 aa  186  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 		 1023 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  22.37 
 
 		 1105 aa  184  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5560  acriflavin resistance protein  22.67 
 
 		 1093 aa  184  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 		 1022 aa  183  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1051 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  24.21 
 
 		 1035 aa  182  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  24.72 
 
 		 1028 aa  182  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1030 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.17 
 
 		 1024 aa  181  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1047 aa  181  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  29.44 
 
 		 1046 aa  181  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2780  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1021 aa  181  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.51782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1047 aa  181  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1047 aa  181  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1047 aa  181  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1036 aa  181  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1051 aa  181  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1055 aa  180  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1058 aa  180  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1009 aa  179  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1051 aa  179  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1033 aa  178  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1033 aa  178  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1033 aa  178  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.23 
 
 		 1034 aa  178  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1014 aa  178  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.17 
 
 		 1046 aa  177  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1034 aa  177  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1065 aa  177  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1033 aa  177  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  28.3 
 
 		 1023 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1037 aa  176  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1016 aa  175  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1042 aa  175  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3691  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1041 aa  174  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4744  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1028 aa  174  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1035 aa  174  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1388  acriflavin resistance protein  26.75 
 
 		 1078 aa  174  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  27.01 
 
 		 1037 aa  173  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  24.09 
 
 		 1031 aa  173  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2655  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1031 aa  173  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1027 aa  172  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2152  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27 
 
 		 1076 aa  172  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.233528  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  26.17 
 
 		 1036 aa  172  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28790  acriflavin resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  27.84 
 
 		 1035 aa  172  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1017 aa  172  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1029 aa  172  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1067 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  24.2 
 
 		 1038 aa  172  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1062 aa  171  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.53 
 
 		 1024 aa  171  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1047 aa  171  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>