More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1552 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1552  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0365883  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  31.4 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3178  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3503  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.061821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03181  transcription regulator protein  30.56 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.30577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4178  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4310  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  29.69 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  31.01 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  28.42 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  27.59 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2973  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35250  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.587508 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1565  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5300  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.233752 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5209  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405506  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1512  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.607249  normal  0.542943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2886  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0958949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5348  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1782  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2707  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.52 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0135797  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 328 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 298 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  29.37 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4420  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  28.48 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0173  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130123 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 328 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  28.48 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2045  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  28.23 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  29.02 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3188  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2583  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.0132829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>