More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1294 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  520  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5383  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 325 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 325 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  27.98 
 
 		 281 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 272 aa  91.7  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3835  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4557  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.194506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 255 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  25.11 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2339  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  24.54 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  25 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.17 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  23.74 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  28.81 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  27.51 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>