More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1874 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  100 
 
 
378 aa  753    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  64 
 
 
387 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  61.99 
 
 
389 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  62.29 
 
 
377 aa  444  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  62.09 
 
 
373 aa  401  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  46.78 
 
 
1057 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  46.99 
 
 
347 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  44.26 
 
 
378 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.02 
 
 
366 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  46.88 
 
 
368 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  43.82 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  44.51 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  44.51 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  48.25 
 
 
355 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  45.66 
 
 
357 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  47.81 
 
 
368 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  54.83 
 
 
374 aa  279  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  43.14 
 
 
355 aa  278  8e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
353 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  43.55 
 
 
344 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  43.98 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  44 
 
 
364 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.64 
 
 
369 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  43.87 
 
 
369 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  40.38 
 
 
355 aa  272  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  45.1 
 
 
369 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  42.74 
 
 
390 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  42.37 
 
 
369 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.07 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  43.38 
 
 
369 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  50 
 
 
352 aa  269  5e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 
354 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  43.47 
 
 
369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  45.19 
 
 
358 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  39.72 
 
 
357 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  45.35 
 
 
342 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  47.93 
 
 
369 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  48.01 
 
 
352 aa  267  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  43.7 
 
 
371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.22 
 
 
374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  45.19 
 
 
358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  44.64 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  43.67 
 
 
361 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  39.48 
 
 
358 aa  266  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  42.32 
 
 
342 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  43.26 
 
 
369 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
346 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.58 
 
 
370 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  43.97 
 
 
346 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  44.15 
 
 
386 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.15 
 
 
368 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 
342 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.94 
 
 
349 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
371 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  39.89 
 
 
405 aa  260  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
405 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.38 
 
 
373 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  43.77 
 
 
342 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  47 
 
 
357 aa  259  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.73 
 
 
362 aa  259  8e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.73 
 
 
352 aa  258  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  42.45 
 
 
352 aa  258  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.94 
 
 
384 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  43.44 
 
 
410 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  45.19 
 
 
341 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.52 
 
 
423 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  45.71 
 
 
363 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  40.29 
 
 
349 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  53.19 
 
 
352 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.9 
 
 
363 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  42.09 
 
 
353 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  44.38 
 
 
366 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  40.37 
 
 
348 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.67 
 
 
372 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.77 
 
 
353 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.77 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1227  ABC transporter related  42.26 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000640126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  40.29 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  40.57 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  44.04 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  40.29 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  42.2 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
343 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.89 
 
 
378 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.03 
 
 
382 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  42.48 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.36 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  43.57 
 
 
364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  52.19 
 
 
356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  42.86 
 
 
368 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 
349 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.21 
 
 
373 aa  252  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  43.09 
 
 
361 aa  252  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  41.98 
 
 
359 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.56 
 
 
382 aa  253  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
363 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  45.4 
 
 
359 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>