More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2549 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  100 
 
 		 149 aa  303  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  87.16 
 
 		 151 aa  271  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  75.84 
 
 		 148 aa  234  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  75.17 
 
 		 146 aa  232  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  72.48 
 
 		 149 aa  229  8.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  48.91 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  50.72 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  48.53 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  45.99 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  45.26 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  44.6 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  45.99 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  43.26 
 
 		 138 aa  119  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  42.76 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  40.58 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  45.26 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  45.59 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  45.59 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  37.41 
 
 		 179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  42.65 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  40.71 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  31.76 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  38.73 
 
 		 185 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  31.29 
 
 		 200 aa  87.4  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  37.24 
 
 		 182 aa  87  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  33.97 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.03 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  36.17 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  38.02 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  35.46 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  30.41 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  33.57 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  29.8 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  31.93 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  31.09 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  31.09 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  31.75 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  33.05 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  30.08 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  29.27 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  30.25 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  26.67 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  29.66 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  27.2 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  33.83 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  28.35 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  30.77 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  31.5 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  25.9 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  28.1 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  30.16 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  32.48 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  29.75 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  30.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  29.75 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  30.51 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  29.75 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  25.9 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  29.63 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  32.48 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  25.9 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  25.9 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  28.93 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  31.62 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  29.75 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  28.93 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  31.36 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  28.93 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  28.93 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  28.99 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  27.73 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  29.66 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  30.58 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  28.93 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  29.91 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  32.23 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>