More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1857 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1857  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 345 aa  688    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0015  MscS Mechanosensitive ion channel  70.69 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  54.4 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  49.68 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2475  MscS Mechanosensitive ion channel  55.02 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288536  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 404 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 456 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 366 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 310 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 322 aa  92.4  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 369 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 359 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  28.92 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  26.71 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  24.81 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  26.32 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  31.49 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  22.89 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  23.75 
 
 		 1105 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.36 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.44 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 833 aa  82.8  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  27.02 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  22.79 
 
 		 813 aa  82.4  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  25.48 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  24.05 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  24 
 
 		 287 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  23.23 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  30.94 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  25.09 
 
 		 981 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 560 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 752 aa  75.9  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  24.16 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.66 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  23.41 
 
 		 862 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  32.3 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  23.77 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 636 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 636 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  23.65 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  29.3 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  29.3 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 		 877 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  25.61 
 
 		 531 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  24.11 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  25.09 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 843 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  28.65 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  30.17 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  22.96 
 
 		 361 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  31.66 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  24.61 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  21.22 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>