More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6895 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6895  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 474 aa  918    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  34.38 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  39.41 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  39.42 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  32.09 
 
 		 459 aa  273  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  37.95 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  36.06 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 455 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  36.12 
 
 		 473 aa  262  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  32.63 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  32.23 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  38.28 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 461 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 		 454 aa  259  9e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 475 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  39.8 
 
 		 478 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  33.88 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  33.4 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 461 aa  256  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  31.95 
 
 		 463 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  31.95 
 
 		 460 aa  255  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  32.44 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  37.32 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  37.87 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 475 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 476 aa  252  9.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  31.19 
 
 		 455 aa  251  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 463 aa  250  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 		 475 aa  249  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4904  tRNA modification GTPase TrmE  37.7 
 
 		 478 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  32.22 
 
 		 459 aa  249  8e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  32.22 
 
 		 459 aa  249  8e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  37.82 
 
 		 462 aa  249  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 464 aa  249  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  32.22 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  31.74 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  35.37 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  32.24 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  36.12 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  41.04 
 
 		 481 aa  247  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  36.12 
 
 		 460 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  30.91 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  35.58 
 
 		 473 aa  246  8e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  35.58 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 453 aa  246  9e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  34.51 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  41.16 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  36.08 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  34.54 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  35.12 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  32.35 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  32.35 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2881  tRNA modification GTPase TrmE  41.25 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  37.94 
 
 		 455 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  38.89 
 
 		 486 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  38.04 
 
 		 464 aa  243  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  30.96 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  37.23 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  37.81 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  32.29 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  37.02 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 448 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  32.29 
 
 		 458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 464 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  32.71 
 
 		 458 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 464 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4384  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 		 479 aa  239  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  32.29 
 
 		 458 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  32.29 
 
 		 458 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  32.08 
 
 		 458 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  36.69 
 
 		 448 aa  239  8e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  38.6 
 
 		 467 aa  239  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  36.63 
 
 		 462 aa  239  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  38.64 
 
 		 458 aa  239  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  34.03 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  32.5 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  32.5 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  32.5 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  32.5 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  39.67 
 
 		 452 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  36.2 
 
 		 462 aa  237  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  36.55 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 448 aa  236  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 455 aa  236  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  31.5 
 
 		 460 aa  236  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  39.63 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>