276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0715 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 618 aa  1211    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.62 
 
 		 598 aa  331  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.92 
 
 		 572 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  28.57 
 
 		 582 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 594 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 666 aa  160  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  29.44 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 493 aa  124  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 642 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 1052 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 748 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 590 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  27.3 
 
 		 588 aa  108  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 574 aa  107  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  33.08 
 
 		 298 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 1042 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 732 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 603 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 572 aa  98.6  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 580 aa  98.2  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 569 aa  98.2  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 689 aa  96.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  33.46 
 
 		 343 aa  95.5  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 785 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 579 aa  92.8  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 438 aa  92.8  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 596 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  29.54 
 
 		 588 aa  90.1  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 708 aa  89  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  29.24 
 
 		 294 aa  88.6  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  27.92 
 
 		 557 aa  88.2  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  29.04 
 
 		 322 aa  87  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  31 
 
 		 265 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  33.58 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 729 aa  84.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.04 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.72 
 
 		 655 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.88 
 
 		 887 aa  80.9  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 685 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.75 
 
 		 616 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  20.05 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0318  putative PAS/PAC sensor protein  26.8 
 
 		 590 aa  77.4  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375606  normal  0.106516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.42 
 
 		 1034 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  24.49 
 
 		 573 aa  77  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  24.49 
 
 		 573 aa  77  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 566 aa  76.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 404 aa  76.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 654 aa  74.3  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 578 aa  73.6  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.59 
 
 		 1039 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 710 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 593 aa  72  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  29.05 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 617 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1742  putative PAS/PAC sensor protein  28.38 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  25.83 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 362 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1357  histidine kinase A domain protein  26.46 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.126794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 958 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4249  putative PAS/PAC sensor protein  27.56 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  23.53 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 663 aa  64.3  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.51 
 
 		 581 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 		 893 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0676  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 670 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.701662  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.38 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  22.44 
 
 		 738 aa  60.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 974 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  37.84 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 858 aa  57.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 830 aa  57.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  20.5 
 
 		 588 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3269  diguanylate cyclase  23.31 
 
 		 492 aa  57  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  22.62 
 
 		 608 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.62 
 
 		 608 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  23.51 
 
 		 571 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  22.62 
 
 		 608 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  22.62 
 
 		 608 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  22.62 
 
 		 608 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  21.33 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>