More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1329 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
316 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.655349  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29217  predicted protein  32.13 
 
 
393 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
335 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000012318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
324 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_4266  predicted protein  28.52 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.21 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  31.75 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  30.9 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  31.03 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  28.44 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.41 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  26.15 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  29.13 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  26.63 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  26.15 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  28.91 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  28.82 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.13 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
273 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  26.54 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
308 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  25.13 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  26.83 
 
 
661 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
214 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.96 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
239 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  29.31 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.96 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 
339 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  27.4 
 
 
333 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  27.4 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  25.71 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.4 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.08 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  26.42 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
288 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 
280 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.73 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.981527  normal  0.0865499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3427  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779859  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  28.24 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  29.11 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
240 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  26.63 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.24 
 
 
272 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.48 
 
 
271 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
206 aa  56.2  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
292 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  28.57 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10815  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  27.07 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0985309  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  32.28 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>