More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3103 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3103  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
322 aa  643    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3325  protein-export membrane protein SecF  56.27 
 
 
324 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  56.51 
 
 
324 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0505  protein-export membrane protein SecF  56.1 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0158635  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  49.09 
 
 
317 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  40.92 
 
 
291 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  35.29 
 
 
302 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  35.29 
 
 
301 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 
301 aa  192  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  35.99 
 
 
310 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  39.35 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  35.41 
 
 
735 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.05 
 
 
755 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.41 
 
 
754 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.67 
 
 
754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.67 
 
 
754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.47 
 
 
754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.67 
 
 
754 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  36.2 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.34 
 
 
754 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.34 
 
 
754 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.02 
 
 
754 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  35.45 
 
 
280 aa  172  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.89 
 
 
754 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.91 
 
 
750 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  35.08 
 
 
286 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.69 
 
 
750 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  38.64 
 
 
292 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  33.97 
 
 
328 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  34.11 
 
 
761 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  34.73 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  40.4 
 
 
310 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.83 
 
 
752 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  37.29 
 
 
293 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 
325 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.88 
 
 
759 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.88 
 
 
759 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.92 
 
 
763 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  31.21 
 
 
312 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  32.13 
 
 
311 aa  149  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  33.98 
 
 
303 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.11 
 
 
990 aa  148  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  30.49 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  34.39 
 
 
336 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  31.17 
 
 
311 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.88 
 
 
989 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  32.35 
 
 
301 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  32.89 
 
 
1029 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  32.69 
 
 
301 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  31.89 
 
 
309 aa  142  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  30.7 
 
 
412 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  32.79 
 
 
310 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  31.96 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  32.49 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  30.79 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  32.58 
 
 
302 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  32.8 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  32.25 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.67 
 
 
785 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.67 
 
 
785 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  31.73 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  32.57 
 
 
311 aa  136  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32 
 
 
759 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  31.85 
 
 
310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  32.51 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  36.03 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  31.48 
 
 
307 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  32.04 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  29.9 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  35.29 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  33.67 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  31.67 
 
 
308 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.66 
 
 
748 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  30.79 
 
 
314 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 
308 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  33.55 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.65 
 
 
1055 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  32.92 
 
 
414 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  30.94 
 
 
302 aa  133  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  31.02 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  32.85 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  28.57 
 
 
977 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.69 
 
 
995 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  32.12 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.23 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  32.23 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.97 
 
 
991 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  33.55 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  31.6 
 
 
321 aa  129  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  29.01 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.36 
 
 
911 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  31.48 
 
 
900 aa  129  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  29.3 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  32.35 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  31.6 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  30.94 
 
 
318 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  32.67 
 
 
316 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  29.62 
 
 
318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  31.06 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.161965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>