More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1853 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1853  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 71 aa  144  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 835 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 940 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1284  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 1000 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 910 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.98 
 
 		 923 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  46 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 913 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5085  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 260 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  43.28 
 
 		 919 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 879 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 260 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 368 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 943 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  45 
 
 		 904 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3005  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00815247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  45 
 
 		 924 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  42.03 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2699  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.27 
 
 		 981 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  39.62 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0029  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0011  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2675  Tetratricopeptide TPR_4  43.4 
 
 		 870 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00129539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 781 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 1052 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 541 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.66 
 
 		 1021 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 992 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2290  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 493 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2941  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 251 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 216 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 545 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  44.23 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  41.38 
 
 		 879 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1533  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.717435  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4192  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 251 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 231 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 928 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.54 
 
 		 867 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 216 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2696  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 535 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 918 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0179  LuxR family DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 219 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 491 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4737  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 241 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0133592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3106  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 239 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 998 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 497 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 887 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 219 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 219 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 224 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4590  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 244 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  normal  0.147521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 211 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 207 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4220  response regulator receiver  40 
 
 		 244 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.89842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.94 
 
 		 873 aa  47.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02970  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.16 
 
 		 227 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.611463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  35.85 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  44.44 
 
 		 496 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 212 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 544 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 881 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 454 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 544 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 881 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  43.33 
 
 		 933 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 216 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 544 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 876 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 471 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 514 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 510 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>