More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1284 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1284  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 209 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4796  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00878953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2335  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.938318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2086  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1286  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.233078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5301  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0298564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1285  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 209 aa  148  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0996283  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1662  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214082  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  29.56 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.04 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.631365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.06 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1595  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0474  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  27.8 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  26.6 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.25 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  27.5 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1276  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.88 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161375  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  25.62 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  25.12 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  30 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  30 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  30 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5755  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15816  normal  0.181841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  30 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  30 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  24.26 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.26 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  24.26 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  24.26 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 218 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  23.76 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3743  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.4 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  24.26 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  24.26 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.12 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  24.26 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  23.76 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  26.11 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  24.26 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.87 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  27.59 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  23.76 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  27.72 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  31.58 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  31.58 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  23.76 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  26.6 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  26 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>