More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5301 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5301  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0298564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1286  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 215 aa  235  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.233078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2086  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.41 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2335  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.938318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4796  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00878953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1284  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1662  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214082  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1285  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0996283  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  29.33 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  35.53 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  29.25 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  27.62 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  28.16 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 271 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  34.16 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  31.25 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  28.77 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  31.63 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  30.66 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  28.3 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  28.3 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  28.3 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  26.89 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  27.83 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  28.3 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  26.92 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  28.3 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  28.3 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  31.88 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  28.57 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  28.3 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  28.5 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3743  two component LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  27.36 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  28.71 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1276  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.72 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161375  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1571  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.82 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  29.67 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  29.21 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  29.21 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4250  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  29.67 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  28.23 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  28.23 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.47 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  30.77 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  31.07 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000268807  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.75 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.37 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  28.37 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  28.37 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>