More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1295 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1295  dehydrogenase  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  30.36 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  28.97 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  27.71 
 
 		 251 aa  92  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  28.75 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  28.1 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  24.15 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  27.82 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  24.15 
 
 		 331 aa  85.1  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  28.98 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 		 284 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 		 284 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.41 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  27.5 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  28.05 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  29.27 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  25.73 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  29.63 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  29.24 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  30.13 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  26.75 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  28.86 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  28.21 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.22 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2737  acetoin dehydrogenase  29.22 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  27.38 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  24.79 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.38 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.49 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  29.29 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  26.92 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  24.89 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  29.83 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  26.85 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  26.75 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  26.85 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  24.9 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.51 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  26.21 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.61 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1510  acetoin dehydrogenase  27.98 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2272  acetoin dehydrogenase  27.98 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.71 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.02 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  25.62 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  27.59 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  24.89 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  25.21 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.53 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0834  acetoin dehydrogenase  27.57 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  25.83 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3264  acetoin dehydrogenase  27.57 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0298905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3469  putative short-chain dehydrogenase  24.79 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.29 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  28 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.33 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  27.54 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.21 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.890933  normal  0.0516654 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.4 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  24.29 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  26.53 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.2 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.76 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>