More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0642 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  43.65 
 
 		 880 aa  669    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 897 aa  1810    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.05 
 
 		 859 aa  326  9e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  31.01 
 
 		 878 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  28.71 
 
 		 855 aa  268  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.42 
 
 		 836 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  32.81 
 
 		 846 aa  233  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  29.14 
 
 		 846 aa  227  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.77 
 
 		 841 aa  206  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.13 
 
 		 843 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  29.56 
 
 		 871 aa  202  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 848 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 838 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.29 
 
 		 847 aa  197  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.99 
 
 		 835 aa  194  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25.87 
 
 		 845 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  28.73 
 
 		 857 aa  184  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.5 
 
 		 856 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 		 861 aa  180  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.39 
 
 		 842 aa  177  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.74 
 
 		 854 aa  177  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 852 aa  171  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  28.45 
 
 		 855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  25.23 
 
 		 825 aa  165  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 		 839 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  24.3 
 
 		 849 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  23.63 
 
 		 849 aa  159  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 834 aa  157  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  26.97 
 
 		 828 aa  152  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.24 
 
 		 821 aa  151  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 853 aa  141  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 930 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  25.04 
 
 		 873 aa  116  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 806 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 		 853 aa  112  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34.39 
 
 		 738 aa  108  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  27.93 
 
 		 866 aa  107  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  26.55 
 
 		 859 aa  101  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 		 857 aa  92.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 855 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  25.16 
 
 		 853 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  21.53 
 
 		 856 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 		 826 aa  79.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  36 
 
 		 861 aa  78.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.33 
 
 		 863 aa  78.2  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.57 
 
 		 855 aa  77  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  21.89 
 
 		 852 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  24.32 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  21.26 
 
 		 858 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  23.66 
 
 		 841 aa  75.5  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0909  hypothetical protein  27.95 
 
 		 813 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 833 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.67 
 
 		 858 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  24.16 
 
 		 857 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  27.6 
 
 		 414 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 443 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1074  hypothetical protein  22.66 
 
 		 866 aa  70.1  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  29.63 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  27.1 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  23.47 
 
 		 854 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  29.63 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  29.63 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  29.63 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  29.63 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 		 873 aa  67.4  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  28.89 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 822 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  26.9 
 
 		 402 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  29.2 
 
 		 885 aa  64.3  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  28.46 
 
 		 393 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.66 
 
 		 409 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  21.96 
 
 		 868 aa  64.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  36.07 
 
 		 438 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  23.79 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.12 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  30.89 
 
 		 441 aa  63.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.18 
 
 		 850 aa  62.4  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  22.8 
 
 		 896 aa  62.4  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  28.82 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  27.46 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  22.87 
 
 		 430 aa  62  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  28.86 
 
 		 646 aa  62  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 402 aa  62  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  20.98 
 
 		 855 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.84 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  35.38 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  25.37 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.72 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.71 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  30.22 
 
 		 398 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  32.28 
 
 		 413 aa  60.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  23.24 
 
 		 408 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>