More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3704 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3704  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.21281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  49.2 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 193 aa  90.9  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 192 aa  90.9  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  32 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  30.81 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  33.52 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  30.23 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  30.6 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
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NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
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NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
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NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.45 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
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NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  29.45 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1841  transcriptional regulator, TetR family protein  25.28 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  28.22 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
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NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  35.23 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
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