77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3686 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  49.48 
 
 		 973 aa  892    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  100 
 
 		 918 aa  1894    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  47.42 
 
 		 925 aa  830    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  48.08 
 
 		 621 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1154 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1173 aa  467  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1018 aa  462  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1151 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  32.36 
 
 		 1170 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  31.76 
 
 		 1186 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1188 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1184 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  30.94 
 
 		 869 aa  304  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  28.03 
 
 		 978 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  39.82 
 
 		 333 aa  201  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  24.7 
 
 		 909 aa  192  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  24.29 
 
 		 908 aa  190  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  26.98 
 
 		 871 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 		 430 aa  173  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  23.45 
 
 		 912 aa  161  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  23.55 
 
 		 933 aa  160  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  29.72 
 
 		 914 aa  158  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  25.03 
 
 		 955 aa  154  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  23.18 
 
 		 919 aa  152  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  25.04 
 
 		 934 aa  151  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  26.89 
 
 		 928 aa  150  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1347 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1321 aa  148  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1282 aa  147  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  30 
 
 		 1339 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  30 
 
 		 1339 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1347 aa  143  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  27.92 
 
 		 916 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  24.87 
 
 		 929 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1346 aa  141  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  26.58 
 
 		 937 aa  140  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  27.39 
 
 		 934 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1353 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1342 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.71 
 
 		 929 aa  128  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1363 aa  128  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  28.7 
 
 		 536 aa  127  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  27.25 
 
 		 926 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1365 aa  125  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1290 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1440 aa  122  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.51 
 
 		 918 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1452 aa  120  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1366 aa  119  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1243 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  24.52 
 
 		 932 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1409 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  25.15 
 
 		 921 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1461 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.07 
 
 		 926 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  25.68 
 
 		 928 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  25.47 
 
 		 928 aa  112  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.34 
 
 		 909 aa  108  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  25.84 
 
 		 941 aa  105  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2486  hypothetical protein  41.9 
 
 		 123 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.658764  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.31 
 
 		 974 aa  86.3  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3224  hypothetical protein  28.09 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1298 aa  63.9  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  21.31 
 
 		 1041 aa  60.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  23.45 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1339 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.93 
 
 		 504 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1338 aa  51.6  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  23.74 
 
 		 1089 aa  51.2  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  20.05 
 
 		 1076 aa  50.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1154 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  39.74 
 
 		 1318 aa  47  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1141 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1022 aa  45.8  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  20.4 
 
 		 1426 aa  45.8  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.28 
 
 		 1432 aa  44.3  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>