More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0930 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0695  GntR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6375  GntR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.405237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6608  GntR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0123942 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6206  GntR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00935659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  42.08 
 
 		 228 aa  160  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3435  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.478263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.05 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.65 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0471  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.915136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>