174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0134 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  778    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  45.52 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  40.88 
 
 		 510 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  29.78 
 
 		 314 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  27.23 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  44.74 
 
 		 357 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  38.79 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  28.46 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  26.01 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  26.01 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  27.3 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  34.59 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  25.42 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  42.71 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  26.52 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  44.12 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  33.55 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  38.57 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  23.73 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  42.65 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  44.93 
 
 		 245 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  30.82 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  30.82 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  37.63 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  40.98 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  36.23 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  33.9 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  31.93 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  44.93 
 
 		 246 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  36.44 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  42.03 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  29.56 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  36.44 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  32.52 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  31.87 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  29.05 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  41.18 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  41.18 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.24 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  43.48 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  36.03 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  37.33 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  29.73 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  36.28 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  35.38 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  41.43 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  43.08 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  38.96 
 
 		 266 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  40 
 
 		 271 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  40.28 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  40.85 
 
 		 300 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  26.38 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  35.04 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  33.62 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  34.25 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 339 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  32.8 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  38.2 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 342 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  27.78 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  31.21 
 
 		 360 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 281 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 285 aa  53.5  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  37.97 
 
 		 511 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  26.43 
 
 		 307 aa  53.5  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  27.9 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  34.52 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  38.24 
 
 		 342 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  30.43 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>