257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1812 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 318 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  88.68 
 
 		 315 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  31.85 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  31.98 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  33.83 
 
 		 347 aa  139  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  38.12 
 
 		 344 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  36.12 
 
 		 611 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  39.05 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  38.43 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  32.1 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  31.35 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  33.59 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  31.88 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  36.18 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  41.18 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  39.15 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  39.05 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  30.83 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  35.87 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  34.66 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  32.76 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  25.94 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  36.15 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  30.82 
 
 		 337 aa  99  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.85 
 
 		 599 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  29.57 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  32.23 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  29.23 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  34.68 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  29.96 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  29.91 
 
 		 601 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  31.95 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 		 328 aa  89.4  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  30.88 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 517 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 		 471 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.33 
 
 		 619 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  30.82 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  30.59 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 		 754 aa  86.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  29.6 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  26.72 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  29.28 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  32.64 
 
 		 651 aa  84  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  28.78 
 
 		 646 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  38.69 
 
 		 589 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 690 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  28.64 
 
 		 679 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 692 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 692 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 690 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 693 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 681 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 687 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  32.78 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.49 
 
 		 576 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  31.53 
 
 		 701 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 653 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  33.57 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 701 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  32.33 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  27.93 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  32.45 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 650 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 664 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 		 595 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  29.61 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  28.84 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 647 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.65 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 693 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  29.26 
 
 		 667 aa  76.3  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.92 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  29.19 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  27.39 
 
 		 658 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  32.2 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 644 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  29.83 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  26.52 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  32.2 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  32.2 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  31.84 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.4 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  33.53 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  30.34 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  32.17 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  27.73 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.57 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  26.4 
 
 		 690 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 691 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>