249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1569 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  90.46 
 
 		 388 aa  705    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 388 aa  795    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  52.97 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.84 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.56 
 
 		 455 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.85 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.45 
 
 		 450 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.45 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.19 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.95 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.04 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.47 
 
 		 414 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.88 
 
 		 392 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.57 
 
 		 460 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  45.38 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  45.43 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.66 
 
 		 570 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  39.84 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  39.02 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.44 
 
 		 520 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.53 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  40.05 
 
 		 488 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  36.27 
 
 		 482 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  33.72 
 
 		 471 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  37.86 
 
 		 400 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  34.88 
 
 		 469 aa  176  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  35.69 
 
 		 676 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  31.81 
 
 		 766 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  32.71 
 
 		 2172 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  34.03 
 
 		 875 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  39.18 
 
 		 748 aa  145  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.65 
 
 		 1657 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  31.25 
 
 		 712 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  33.81 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  30.53 
 
 		 518 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  34.26 
 
 		 841 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  31.03 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  31.55 
 
 		 369 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  30.34 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  27.84 
 
 		 1132 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  27.3 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  32.63 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  31.78 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  34.2 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  31.88 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  31.33 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  29.52 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  26.88 
 
 		 972 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  28.69 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  32.42 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  32.9 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  32.58 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  33.71 
 
 		 408 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  29.94 
 
 		 1029 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  28.42 
 
 		 428 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 		 374 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  32.27 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  26.8 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.49 
 
 		 729 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  32.04 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  29.52 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  28.86 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  28.05 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.72 
 
 		 892 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.99 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  27.57 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  29.47 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.23 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  27.18 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  27.79 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  25.59 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  28.49 
 
 		 999 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  28.49 
 
 		 999 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  28.49 
 
 		 999 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  33.07 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  30.39 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  29.13 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  27.59 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  27.68 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  25.38 
 
 		 561 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 		 442 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  29.75 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  26.69 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  30.67 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  27.06 
 
 		 407 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  27.98 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.82 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  25.14 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  32.96 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.25 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  26.36 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  24.95 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.94 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  26.75 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  26.65 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  26.94 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  26.05 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>