More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6487 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 780 aa  1541    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  78.81 
 
 		 872 aa  1234    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  44.83 
 
 		 1163 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.94 
 
 		 1481 aa  242  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  40.12 
 
 		 1363 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  41.67 
 
 		 1652 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  47.6 
 
 		 696 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  47.04 
 
 		 1510 aa  231  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  46.64 
 
 		 1553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  47.04 
 
 		 344 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  40.28 
 
 		 947 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  46.88 
 
 		 344 aa  221  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  47.3 
 
 		 1357 aa  218  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.85 
 
 		 740 aa  218  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  43.75 
 
 		 1831 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  44.52 
 
 		 1789 aa  214  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 1221 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  43.55 
 
 		 1367 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  39.68 
 
 		 1236 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  44.1 
 
 		 1229 aa  210  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  44.06 
 
 		 1364 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  47.77 
 
 		 1217 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.71 
 
 		 642 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  43.36 
 
 		 434 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  40.07 
 
 		 1193 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.71 
 
 		 1686 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  43.34 
 
 		 1807 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  38.64 
 
 		 1552 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  45.92 
 
 		 675 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  42.12 
 
 		 1196 aa  200  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  45.61 
 
 		 919 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  41.52 
 
 		 1443 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  38.51 
 
 		 1474 aa  197  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  45.12 
 
 		 924 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  42.25 
 
 		 1599 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  36.01 
 
 		 1868 aa  194  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.07 
 
 		 664 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.93 
 
 		 576 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.41 
 
 		 1240 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.13 
 
 		 676 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  39.8 
 
 		 1161 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  39.8 
 
 		 1161 aa  191  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  44.68 
 
 		 335 aa  187  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.45 
 
 		 677 aa  187  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.31 
 
 		 682 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  37.04 
 
 		 1188 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  39.39 
 
 		 742 aa  184  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  39.71 
 
 		 443 aa  183  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.02 
 
 		 1623 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  38.6 
 
 		 1878 aa  182  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.19 
 
 		 1599 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  37.98 
 
 		 1454 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.64 
 
 		 630 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  38.79 
 
 		 1901 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  36.24 
 
 		 1523 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.93 
 
 		 930 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  34.88 
 
 		 649 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  40.74 
 
 		 1211 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.68 
 
 		 1557 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  37.41 
 
 		 1164 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.79 
 
 		 1262 aa  177  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.26 
 
 		 737 aa  177  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  35.54 
 
 		 317 aa  177  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  38.28 
 
 		 1304 aa  177  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  39.36 
 
 		 1656 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.73 
 
 		 596 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  47.46 
 
 		 540 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  39.74 
 
 		 1661 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  35.55 
 
 		 316 aa  174  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  43.82 
 
 		 1766 aa  174  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  37.54 
 
 		 1348 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  34.35 
 
 		 1247 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  36.19 
 
 		 1190 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  39.67 
 
 		 1491 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  39.58 
 
 		 1714 aa  170  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  46.08 
 
 		 790 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  34.49 
 
 		 657 aa  169  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.74 
 
 		 1760 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.24 
 
 		 1609 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.81 
 
 		 1267 aa  168  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 577 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.76 
 
 		 1711 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.15 
 
 		 1547 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  36.08 
 
 		 778 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  32.64 
 
 		 1188 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  32.11 
 
 		 316 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.89 
 
 		 692 aa  165  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.78 
 
 		 1684 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  38.13 
 
 		 1177 aa  164  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  31.67 
 
 		 589 aa  163  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.68 
 
 		 865 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  33.22 
 
 		 316 aa  163  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  31.71 
 
 		 316 aa  161  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.36 
 
 		 833 aa  161  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  33.45 
 
 		 1858 aa  161  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  33.22 
 
 		 1477 aa  160  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  33.15 
 
 		 640 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.31 
 
 		 1039 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 		 687 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  31.48 
 
 		 1208 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>