85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5912 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  53.85 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  47.02 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  44.71 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  45.83 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  42.86 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  41.67 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  41.72 
 
 		 209 aa  120  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  41.88 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  41.88 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  41.88 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  37.5 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  42.5 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  37.34 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  40.57 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  37.33 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  35.03 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  38.89 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  33.95 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  38.06 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  41.49 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  27.95 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  30.38 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  23.42 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  24.53 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  28.3 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  26.88 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  32.97 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  32.61 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28.12 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  29.58 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  34.48 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  29.27 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  31.71 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  31.54 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  27.86 
 
 		 283 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  28.76 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  32.56 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  34.18 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  38.98 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  34.02 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  37.93 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  24 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  32.46 
 
 		 658 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  24.28 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  26.92 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  31.45 
 
 		 522 aa  47.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  30.56 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  30.83 
 
 		 371 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  26.15 
 
 		 504 aa  45.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  34.18 
 
 		 229 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  31.03 
 
 		 198 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  25.52 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  27.48 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  25.17 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  27.48 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  30.99 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  31.75 
 
 		 555 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  27.34 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0948  membrane-flanked domain-containing protein  35.11 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25.17 
 
 		 575 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  25.83 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  37.93 
 
 		 554 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  37.29 
 
 		 501 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  29.58 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  29.58 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  29.58 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3697  membrane-flanked domain-containing protein  34.41 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505338  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  29.58 
 
 		 512 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  30.3 
 
 		 180 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  32 
 
 		 229 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  30.3 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  27.4 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  22.96 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  31.15 
 
 		 541 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  32.08 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  22.06 
 
 		 155 aa  41.2  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>