240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3101 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3101  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 143 aa  273  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.772735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  85.94 
 
 		 540 aa  204  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.31 
 
 		 737 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.7 
 
 		 716 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  81.82 
 
 		 954 aa  60.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  72.97 
 
 		 1357 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  72.97 
 
 		 919 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  70.27 
 
 		 675 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  70.27 
 
 		 405 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  64.86 
 
 		 652 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  69.77 
 
 		 335 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  64.86 
 
 		 1557 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  67.65 
 
 		 1004 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  67.65 
 
 		 1363 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  69.44 
 
 		 1217 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  62.86 
 
 		 947 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  60.98 
 
 		 1344 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  75.76 
 
 		 696 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  67.65 
 
 		 564 aa  55.1  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  63.89 
 
 		 1163 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 1221 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  64.86 
 
 		 1211 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  70.59 
 
 		 742 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  70.59 
 
 		 828 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  39.71 
 
 		 1652 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.16 
 
 		 1711 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4047  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  67.57 
 
 		 916 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1470  WD40 repeat, subgroup  62.5 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  61.76 
 
 		 1236 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  61.76 
 
 		 1208 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  64.71 
 
 		 1196 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 1190 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  65.71 
 
 		 1858 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  69.7 
 
 		 790 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  65 
 
 		 1523 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  63.64 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  71.88 
 
 		 1661 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  57.14 
 
 		 1552 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60 
 
 		 676 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  66.67 
 
 		 335 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  65.71 
 
 		 608 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  58.82 
 
 		 630 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60 
 
 		 733 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.29 
 
 		 664 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  66.67 
 
 		 1878 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  66.67 
 
 		 1364 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  68.42 
 
 		 1267 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  60.61 
 
 		 1686 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  43.06 
 
 		 1657 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  63.89 
 
 		 344 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  70 
 
 		 1553 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  30.71 
 
 		 914 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60.98 
 
 		 682 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  43.66 
 
 		 577 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  55.81 
 
 		 757 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  55.88 
 
 		 316 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  57.14 
 
 		 930 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  60 
 
 		 317 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  60.87 
 
 		 994 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  56.76 
 
 		 1193 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  61.76 
 
 		 1183 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  64.71 
 
 		 1188 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  65.62 
 
 		 1348 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  64.86 
 
 		 461 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  45.83 
 
 		 589 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  55.88 
 
 		 677 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  60.61 
 
 		 434 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  66.67 
 
 		 1481 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  62.5 
 
 		 792 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  66.67 
 
 		 1176 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  47.06 
 
 		 490 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  63.64 
 
 		 1714 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  56.76 
 
 		 924 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  60 
 
 		 1247 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  62.5 
 
 		 657 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  63.64 
 
 		 1607 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  58.97 
 
 		 1598 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  58.82 
 
 		 1760 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  62.5 
 
 		 1789 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  63.64 
 
 		 1213 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  66.67 
 
 		 1510 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  55.56 
 
 		 316 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  61.11 
 
 		 344 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  61.11 
 
 		 642 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  56.76 
 
 		 1240 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  58.82 
 
 		 316 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42930  predicted protein  47.22 
 
 		 661 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.816964  normal  0.204876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  51.16 
 
 		 316 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  62.5 
 
 		 622 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  55.88 
 
 		 316 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51367  predicted protein  47.22 
 
 		 661 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149439  normal  0.0143416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  42.19 
 
 		 1399 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.36 
 
 		 1609 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  62.5 
 
 		 1599 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  58.97 
 
 		 1583 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  62.5 
 
 		 1373 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  55.88 
 
 		 1474 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  56.25 
 
 		 1097 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  63.64 
 
 		 1041 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  57.58 
 
 		 1161 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>