140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0635 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1052    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  36.97 
 
 		 380 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  32.28 
 
 		 497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  38.46 
 
 		 395 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  35.77 
 
 		 391 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 564 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  28.98 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  34.96 
 
 		 387 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  31.46 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  34.01 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  38.24 
 
 		 431 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  32.45 
 
 		 415 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 		 453 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  37.55 
 
 		 463 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  32.61 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  30.79 
 
 		 399 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  31.37 
 
 		 418 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  31.68 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  31.23 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  33.72 
 
 		 334 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  31.28 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  34.85 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  36.32 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  30.07 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  30.67 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  35.64 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  30.96 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  33.67 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  31.2 
 
 		 424 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  35.02 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  32.99 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  32.75 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  34.5 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  31.07 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  28.46 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  30.24 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  28.46 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  30.24 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  33.5 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  36.84 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  31.3 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  37.59 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  34.32 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  28.38 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  28.43 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  33.85 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  19.6 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.01 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  35.14 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  27.79 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  37.8 
 
 		 453 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  38.61 
 
 		 431 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  34.21 
 
 		 380 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  30.04 
 
 		 450 aa  54.3  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  35.25 
 
 		 426 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  27.02 
 
 		 432 aa  53.9  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  36.71 
 
 		 391 aa  53.9  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  20.6 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.19 
 
 		 428 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  34.74 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  28.17 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  33.82 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  24.81 
 
 		 363 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 		 552 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  27.96 
 
 		 380 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  24.38 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  32.43 
 
 		 370 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  31.35 
 
 		 393 aa  50.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  30.52 
 
 		 384 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  28.69 
 
 		 391 aa  50.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  30.52 
 
 		 384 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  35.64 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  30.77 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  35.64 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  17.9 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  28.86 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  31.25 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  32.59 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  35.19 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1195  hypothetical protein  41.07 
 
 		 305 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.384793  normal  0.395106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  26.12 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  30.21 
 
 		 312 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  34.53 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  30.26 
 
 		 336 aa  48.9  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.27 
 
 		 458 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  34.65 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  30.7 
 
 		 357 aa  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  30.05 
 
 		 412 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  33.66 
 
 		 325 aa  47.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  32.17 
 
 		 454 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  37.04 
 
 		 331 aa  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  36.63 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  32.12 
 
 		 457 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.74 
 
 		 446 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  42.59 
 
 		 316 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  32.04 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  35.64 
 
 		 449 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  35.64 
 
 		 449 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>