246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4078 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4078  putative integral membrane export protein  100 
 
 		 749 aa  1439    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1576  RND superfamily drug efflux protein  53.72 
 
 		 864 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.56 
 
 		 752 aa  277  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  32.01 
 
 		 735 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.9 
 
 		 758 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.5 
 
 		 717 aa  257  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  32.03 
 
 		 737 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.44 
 
 		 726 aa  243  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.56 
 
 		 729 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.75 
 
 		 760 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.22 
 
 		 735 aa  217  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.2 
 
 		 718 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.99 
 
 		 724 aa  206  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  29.66 
 
 		 749 aa  201  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  29.4 
 
 		 920 aa  200  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.06 
 
 		 781 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.12 
 
 		 743 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  29.83 
 
 		 793 aa  192  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  29.8 
 
 		 734 aa  191  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  30.94 
 
 		 842 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  30.93 
 
 		 876 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  24.44 
 
 		 829 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  24.44 
 
 		 829 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  30.99 
 
 		 731 aa  184  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  29.13 
 
 		 742 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  29.58 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  29.34 
 
 		 734 aa  178  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  30.47 
 
 		 728 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  30.56 
 
 		 751 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  31.51 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  28.35 
 
 		 732 aa  171  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  29.43 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.4 
 
 		 723 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  30.04 
 
 		 832 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  29.84 
 
 		 714 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  30.94 
 
 		 724 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  30.83 
 
 		 743 aa  162  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.05 
 
 		 704 aa  160  9e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  24.65 
 
 		 893 aa  159  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  29.34 
 
 		 737 aa  159  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  26.03 
 
 		 779 aa  154  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  26.78 
 
 		 740 aa  152  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  26.84 
 
 		 787 aa  151  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.63 
 
 		 735 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  33.26 
 
 		 841 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  28.4 
 
 		 903 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  30.94 
 
 		 732 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  26.97 
 
 		 909 aa  143  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  30.41 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  29.06 
 
 		 723 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  30.41 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  30.41 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.07 
 
 		 746 aa  140  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  30.12 
 
 		 715 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  31.02 
 
 		 836 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  29.27 
 
 		 903 aa  137  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  29.91 
 
 		 1002 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  28.59 
 
 		 735 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  27.74 
 
 		 750 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  29.19 
 
 		 734 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  27.99 
 
 		 779 aa  134  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.86 
 
 		 796 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  26.71 
 
 		 917 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  28.19 
 
 		 1058 aa  128  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  27.09 
 
 		 766 aa  127  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.74 
 
 		 1382 aa  126  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  24.47 
 
 		 758 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  28.77 
 
 		 854 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1092 aa  121  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  28.04 
 
 		 807 aa  121  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.25 
 
 		 740 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  28.76 
 
 		 717 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  35.34 
 
 		 776 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  24.64 
 
 		 710 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  27.99 
 
 		 737 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  28.24 
 
 		 843 aa  117  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  30.41 
 
 		 711 aa  117  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  27.57 
 
 		 733 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  29.29 
 
 		 738 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  27.83 
 
 		 840 aa  114  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  26.43 
 
 		 958 aa  114  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  28.27 
 
 		 732 aa  114  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  27.83 
 
 		 726 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  24.52 
 
 		 741 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  24.8 
 
 		 737 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.42 
 
 		 738 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  27.12 
 
 		 743 aa  108  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  27.13 
 
 		 839 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  26.55 
 
 		 846 aa  105  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  26.15 
 
 		 770 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  26.96 
 
 		 745 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  27.37 
 
 		 787 aa  103  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  26.29 
 
 		 805 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  21.82 
 
 		 730 aa  97.8  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  21.82 
 
 		 730 aa  97.8  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  21.82 
 
 		 730 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  21.82 
 
 		 730 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  30.68 
 
 		 757 aa  97.4  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  28.48 
 
 		 744 aa  97.4  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  21.52 
 
 		 730 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>