280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0826 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  74.39 
 
 		 225 aa  257  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 174 aa  194  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  51.93 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  51.93 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  52.41 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  46.11 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  40.49 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  44.97 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  45.51 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  43.12 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  46.15 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 170 aa  128  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  39.13 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  41.55 
 
 		 142 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  44.1 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  43.57 
 
 		 146 aa  118  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 		 139 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  41.06 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  40.41 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  41.96 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  41.26 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  39.73 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  38.71 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  41.26 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 144 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  40.56 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 144 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  41.96 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  38.96 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  40.26 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  39.87 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  37.76 
 
 		 169 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  42.55 
 
 		 145 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  40.43 
 
 		 156 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  39.16 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  42.55 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  39.87 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  42.55 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  42.55 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  42.55 
 
 		 145 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  39.16 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  41.84 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  37.76 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  34.04 
 
 		 145 aa  99.4  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 		 146 aa  99.4  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  34.97 
 
 		 147 aa  99  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  41.84 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 144 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 144 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  40.43 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  40.43 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  40.43 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  40.43 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  40.43 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  39.72 
 
 		 145 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  39.72 
 
 		 145 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.79 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  34.53 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  28.26 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  39.58 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  28.26 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  36.9 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  38.2 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  31.34 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  34.95 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  35.63 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.34 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.34 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.15 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35.11 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>