105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0573 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 477 aa  934    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  34.57 
 
 		 486 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  35.41 
 
 		 471 aa  277  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  34.26 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  35.11 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  40.2 
 
 		 478 aa  256  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  32.94 
 
 		 471 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  32.76 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  31.85 
 
 		 484 aa  240  5e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  30.04 
 
 		 485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  36.58 
 
 		 472 aa  229  7e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  30.37 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  26.81 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  26.42 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.77 
 
 		 484 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.16 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 418 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  19.33 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  21.41 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  21.41 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  21.41 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  21.41 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  21.41 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  21.41 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  21.41 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  20.44 
 
 		 422 aa  99.8  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  23.22 
 
 		 484 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 484 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 484 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  23.22 
 
 		 484 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  20.23 
 
 		 424 aa  96.7  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 484 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 424 aa  93.2  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  20.41 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 		 418 aa  90.1  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  25.85 
 
 		 416 aa  90.1  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  21.6 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.05 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  23.36 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  20.51 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 490 aa  53.9  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 451 aa  53.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 583 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 478 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 504 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  20.72 
 
 		 498 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  19.29 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  25 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  29.63 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  19.49 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>