131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0417 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 562 aa  1151    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  48.41 
 
 		 555 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  47.58 
 
 		 552 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  47.41 
 
 		 552 aa  481  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  33.33 
 
 		 782 aa  230  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  37.78 
 
 		 679 aa  224  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  34.64 
 
 		 484 aa  220  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  34.01 
 
 		 429 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.33 
 
 		 510 aa  192  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  32.65 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  30.16 
 
 		 578 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  33.55 
 
 		 1020 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  31.29 
 
 		 579 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  30.32 
 
 		 579 aa  150  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  27.77 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  26.35 
 
 		 824 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  30.22 
 
 		 818 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  29.76 
 
 		 722 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  29.3 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  28.17 
 
 		 727 aa  70.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 700 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  25.64 
 
 		 729 aa  67.8  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  24.38 
 
 		 892 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  29.03 
 
 		 708 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.67 
 
 		 733 aa  66.6  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  29.03 
 
 		 708 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5646  hypothetical protein  23.36 
 
 		 666 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  29.03 
 
 		 708 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  27.51 
 
 		 714 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  24.1 
 
 		 726 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  27.51 
 
 		 714 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  29.73 
 
 		 774 aa  64.3  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  25.7 
 
 		 747 aa  63.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  26.55 
 
 		 728 aa  63.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.1 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  28.21 
 
 		 733 aa  63.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  24.46 
 
 		 740 aa  63.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.52 
 
 		 707 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  27.27 
 
 		 718 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  26.62 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  25.99 
 
 		 747 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  27.66 
 
 		 679 aa  62  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  26.88 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  26.58 
 
 		 734 aa  61.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  30.91 
 
 		 729 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  26.25 
 
 		 716 aa  60.8  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  25.31 
 
 		 768 aa  60.8  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  24.72 
 
 		 726 aa  60.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.37 
 
 		 718 aa  60.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  26.02 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  28.03 
 
 		 709 aa  60.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  24.26 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  28.95 
 
 		 530 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.51 
 
 		 735 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.84 
 
 		 729 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  24.86 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  24.86 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  24.86 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  25.84 
 
 		 724 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  25.97 
 
 		 727 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  28.7 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3595  hypothetical protein  22.35 
 
 		 731 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0030344  hitchhiker  0.000112547 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  28 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  25.16 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  24.44 
 
 		 730 aa  57.4  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 730 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  27.56 
 
 		 713 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  27.5 
 
 		 750 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  24.13 
 
 		 734 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  26.07 
 
 		 723 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  26.63 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  24.62 
 
 		 724 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  27.35 
 
 		 707 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.36 
 
 		 699 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  26.04 
 
 		 721 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.2 
 
 		 719 aa  55.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  32.77 
 
 		 775 aa  54.7  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  28.85 
 
 		 729 aa  54.3  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  26.67 
 
 		 631 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  32.77 
 
 		 764 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  32.77 
 
 		 764 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  26.8 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  26.04 
 
 		 715 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  28 
 
 		 694 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  28.3 
 
 		 704 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  31.9 
 
 		 502 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  27.63 
 
 		 722 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  28.35 
 
 		 533 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  23.81 
 
 		 726 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  30.1 
 
 		 699 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  26.75 
 
 		 701 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  25 
 
 		 684 aa  50.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.13 
 
 		 700 aa  50.8  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  29.41 
 
 		 749 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  23.49 
 
 		 723 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  23.49 
 
 		 736 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  30.25 
 
 		 772 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  30.51 
 
 		 771 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  31.09 
 
 		 774 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>